■ 等電点マーカー (pI markers)
キャピラリー等電点電気泳動 (CIEF) では両性担体によってキャピラリー内に pH 勾配を発生させます。実際にキャピラリーの何処にどのような pH 勾配が生じているのかは、等電点マーカー(pI マーカー)を試料に加えることで知ることができます。pI マーカーは等電点が既知の物質で、タンパク質、ペプチド、低分子の有機化合物などが使われます。
志村らは焦点化しやすい 15 種のペプチド等電点マーカーをデザインし、それらの等電点を決定しました。デザインされたペプチドはトリプトファン (Trp) を1残基含み、280 nm の UV 吸収、または 340 nm の蛍光(280 nm 励起)で検出できます。これらのペプチド等電点マーカーはキャピラリー等電点電気泳動における標準的な pI マーカーとして世界中で利用されています。
No.* | Peptide | pI** | SD*** |
28 | H-Trp-Tyr-Lys-Arg-OH | 10.17 | 0.019 |
29 | H-Trp-Tyr-Lys-Lys-OH | 9.99 | 0.025 |
30 | H-Trp-Tyr-Tyr-Lys-Lys-OH | 9.68 | 0.029 |
31 | H-Trp-Tyr-Tyr-Tyr-Lys-Lys-OH | 9.50 | 0.022 |
33 | H-Trp-Glu-Tyr-Tyr-Lys-Lys-OH | 8.40 | 0.028 |
34 | H-Trp-Glu-His-His-His-Arg-OH | 7.27 | 0.012 |
35 | H-Trp-Glu-His-Arg-OH | 7.00 | 0.015 |
36 | H-Trp-Glu-His-His-OH | 6.66 | 0.024 |
37 | H-Trp-Glu-Arg-OH | 5.91 | 0.078 |
38 | H-Trp-Glu-His-OH | 5.52 | 0.025 |
39 | H-Trp-Asp-Asp-His-His-OH | 5.31 | 0.022 |
40 | H-Trp-Glu-Glu-His-OH | 4.28 | 0.035 |
41 | H-Trp-Asp-Asp-Arg-OH | 4.05 | 0.038 |
42 | H-Trp-Glu-Glu-OH | 3.78 | 0.038 |
43 | H-Trp-Asp-Asp-Asp-OH | 3.38 | 0.041 |
** 5回の測定の平均値
*** 5回の測定の標準偏差
文献
- Shimura K, Wang Z, Matsumoto H, Kasai K. Synthetic oligopeptides as isoelectric point markers for capillary isoelectric focusing with ultraviolet absorption detection. Electrophoresis 2000;21(3):603-610.
- Shimura K, Wang Z, Matsumoto H, Kasai K. Accuracy in the determination of isoelectric points of some proteins and a peptide by capillary isoelectric focusing: utility of synthetic peptides as isoelectric point markers. Anal Chem 2000;72(19):4747-4757.
志村らはまた、532 nm のレーザーで励起し、590 nm の蛍光検出に適した、ローダミン標識のペプチド等電点マーカーのデザインと等電点決定も行っています。
文献
- Shimura K, Kamiya K, Matsumoto H, Kasai K. Fluorescence-labeled peptide pI markers for capillary isoelectric focusing. Anal Chem 2002;74(5):1046-1053.