■ 等電点マーカー (pI markers)

キャピラリー等電点電気泳動 (CIEF) では両性担体によってキャピラリー内に pH 勾配を発生させます。実際にキャピラリーの何処にどのような pH 勾配が生じているのかは、等電点マーカー(pI マーカー)を試料に加えることで知ることができます。pI マーカーは等電点が既知の物質で、タンパク質、ペプチド、低分子の有機化合物などが使われます。

志村らは焦点化しやすい 15 種のペプチド等電点マーカーをデザインし、それらの等電点を決定しました。デザインされたペプチドはトリプトファン (Trp) を1残基含み、280 nm の UV 吸収、または 340 nm の蛍光(280 nm 励起)で検出できます。これらのペプチド等電点マーカーはキャピラリー等電点電気泳動における標準的な pI マーカーとして世界中で利用されています。

No.*PeptidepI**SD***
28H-Trp-Tyr-Lys-Arg-OH10.170.019
29H-Trp-Tyr-Lys-Lys-OH9.990.025
30H-Trp-Tyr-Tyr-Lys-Lys-OH9.680.029
31H-Trp-Tyr-Tyr-Tyr-Lys-Lys-OH9.500.022
33H-Trp-Glu-Tyr-Tyr-Lys-Lys-OH8.400.028
34H-Trp-Glu-His-His-His-Arg-OH7.270.012
35H-Trp-Glu-His-Arg-OH7.000.015
36H-Trp-Glu-His-His-OH6.660.024
37H-Trp-Glu-Arg-OH5.910.078
38H-Trp-Glu-His-OH5.520.025
39H-Trp-Asp-Asp-His-His-OH5.310.022
40H-Trp-Glu-Glu-His-OH4.280.035
41H-Trp-Asp-Asp-Arg-OH4.050.038
42H-Trp-Glu-Glu-OH3.780.038
43H-Trp-Asp-Asp-Asp-OH3.380.041
* ペプチド番号
** 5回の測定の平均値
*** 5回の測定の標準偏差

文献  

  1. Shimura K, Wang Z, Matsumoto H, Kasai K. Synthetic oligopeptides as isoelectric point markers for capillary isoelectric focusing with ultraviolet absorption detection. Electrophoresis 2000;21(3):603-610.
  2. Shimura K, Wang Z, Matsumoto H, Kasai K. Accuracy in the determination of isoelectric points of some proteins and a peptide by capillary isoelectric focusing: utility of synthetic peptides as isoelectric point markers. Anal Chem 2000;72(19):4747-4757.

志村らはまた、532 nm のレーザーで励起し、590 nm の蛍光検出に適した、ローダミン標識のペプチド等電点マーカーのデザインと等電点決定も行っています。

文献  

  • Shimura K, Kamiya K, Matsumoto H, Kasai K. Fluorescence-labeled peptide pI markers for capillary isoelectric focusing. Anal Chem 2002;74(5):1046-1053.